2025 年 1 月 1 日，玛丽与路易-巴斯德大学（Université Marie et Louis Pasteur）UMLP以实验性公共机构（EPE）的身份取代了弗朗什-孔泰大学（Université de Franche-Comté）和勃艮第-弗朗什-孔泰大学(COMUE UBFC)。 其总部将设在贝桑松。
实验性公立机构（Établissement Public Expérimental，EPE）是法国政府自2018年起大力推动的一种新型高校组织模式，旨在增强高校整合能力，提升国际竞争力。该模式允许综合大学、工程师学院、专业学院等不同类型的高等教育机构，在保持各自学术特色和一定独立性的同时，实现资源共享与统一管理。目前EPE模式的大学有巴黎萨克雷大学、格勒诺布尔阿尔卑斯大学、艾克斯 - 马赛大学等。
贝尔福 - 蒙贝利亚尔技术大学（UTBM）和国立高等机械与微技术工程学院（Supmicrotech ENSMM）是EPE UMLP的两个主要组成部分。
主要合作机构：
✅位于克吕尼的国立高等工艺美术学校（ENSAM）
✅贝桑松大学和医院中心（CHU）
✅贝桑松高等艺术学院（ISBA）
✅位于贝尔福的高等技术和商业学校（ESTA）
✅勃艮第-弗朗什-孔泰法国血液机构（EFS）
✅勃艮第-弗朗什-孔泰CROUS
根据现任校长的说法，这一发展带来了一系列重大变化，将产生真正的活力，增强大学在国内和国际上的吸引力和影响力。
校长特别强调了加上玛丽-巴斯德名字的重要性，玛丽-巴斯德是路易-巴斯德的妻子和科学助手，她为路易-巴斯德的工作做出了重大贡献："这个名字是我们自然而然想到的"。
路易-巴斯德原籍弗朗什-孔泰。 他出生于多尔（Dole），后来搬到阿尔博伊（Arbois），并在贝桑松皇家学院（Collège Royal）获得学士学位。
弗朗什-孔泰大学（现为玛丽与路易-巴斯德大学）成立于 1423 年，是一所位于贝桑松的公立科学、文化和专业机构（EPSCP）。由 12 个部分组成，分别是培训和研究单位（UFR）（通常称为院系）、学校或研究所。 分布在弗朗什-孔泰省的六个地方：贝桑松、贝尔福、蒙贝利亚尔、维苏尔、隆勒-索尼埃和多尔。学校有 6 个培训和研究单位UFR：
🏫语言、人类和社会科学SLHS（贝桑松市中心校区）；
🏫健康科学（贝桑松上夏扎尔校区和汝拉山口蒙贝利亚分校）；
🏫科学和技术ST（贝桑松La Bouloie校区）；
🏫司法、经济、政治和管理科学SJEPG（贝桑松拉布洛伊校区）；
🏫体育运动科学和技术STAPS（贝桑松拉布洛伊校区）；
🏫工业科学、技术和管理科学STGI（贝尔福和蒙贝利亚尔）
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